Para cambiar el tema de Wordpress manualmente, necesitarás editar el archivo wp-config.php (Podrás usar el Administrador de Archivos de tu panel para ello).
Añade el siguiente código a tu archivo wp-config.php (Necesitaras añadir la ruta del tema).
define('TEMPLATEPATH', '/ruta/al/directorio/de/tu/nuevo/tema');
define('STYLESHEETPATH', '/ruta/al/directorio/de/tu/nuevo/tema');
También podrías revisar estas opciones: