Si ves este error:

Verifica tu dominio con DNSchecker y asegúrate de haberlo apuntado a la dirección IP correcta.

Si estás seguro de que el dominio está apuntando correctamente, intenta desmarcar mail.tudominio.com y vuelve a emitir el certificado:

Si ves un mensaje de error de Respuesta no válida de http: //domain.tld/.well-known/acme- ..., puede significar que tu dominio apunta a otra parte o que tienes algunas reglas de bloqueo de acceso en tu .htaccess, esto se puede coregir fácilmente cambiando el nombre (deshabilitando) el archivo .htaccess.

Si ves el mensaje Error creating new order: acme: error code 429 "urn:ietf:params:acme:error:rateLimited" o "Error creating new order :: too many failed authorizations recently": consulta los errores de https://letsencrypt.org/es/docs/rate-limits/, ya que significa que se realizaron demasiados intentos para instalar el certificado. Para solucionar el problema, deberás volver a emitir el certificado después de 7 días.